Электронные счета-фактуры (ЭСФ) и сопроводительные накладные на товары (СНТ) остаются важными инструментами налогового администрирования. В 2026 году изменились правила регистрации в ИС ЭСФ, заверения отдельных ЭСФ, подтверждения исправлений и отзыва документов. Ни одна из этих процедур сама по себе не гарантирует отсутствие налоговых рисков: значение имеют фактическая операция и подтверждающие документы.
Когда применяется биометрия в ИС ЭСФ
Действующие Правила предусматривают биометрию на двух разных этапах. При регистрации участника в ИС ЭСФ по соответствующему статусу, а также при изменении регистрационных данных биометрическую идентификацию проходит сам участник или руководитель юридического лица. При выписке ЭСФ дополнительное биометрическое заверение требуется лишь тогда, когда в отношении налогоплательщика выявлен риск по системе управления рисками. Биометрия не заменяет ЭЦП и не применяется автоматически к каждому входу или каждой ЭСФ. Передавать закрытый ключ ЭЦП другому лицу нельзя.
В каких случаях потребуется сканирование лица:
- При регистрации участника в ИС ЭСФ и изменении его регистрационных данных — в порядке, установленном Правилами.
- При выписке ЭСФ — если система управления рисками выявила в отношении налогоплательщика риск и ИС ЭСФ направила соответствующее оповещение.
Важно: при выписке рискового ЭСФ биометрическая идентификация проводится один раз в день. Правила устанавливают общее количество таких прохождений — три раза; после этого ИС ЭСФ предоставляет возможность дальнейшей выписки без биометрии. Если идентификация не пройдена, соответствующий ЭСФ не регистрируется.
Изменения в правилах выписки ЭСФ
В 2026 году изменился порядок работы с уже выписанными документами. КГД закрыл лазейку, когда поставщик мог в одностороннем порядке отозвать или исправить ЭСФ, тем самым "ломая" зачет по НДС у своего покупателя.
- Подтверждение изменений: Если получатель является плательщиком НДС на соответствующую дату, исправленный или дополнительный ЭСФ, а также отзыв ЭСФ проходят процедуру подтверждения либо отклонения получателем. Для неплательщика НДС действует иной порядок: он вправе отклонить документ в течение 10 календарных дней. Поэтому утверждение, что подтверждение требуется от любого получателя без исключений, неверно.
- Порог 1000 МРП: В Налоговом кодексе, действующем с 2026 года, стоимость гражданско-правовой сделки свыше 1000 МРП не названа самостоятельным основанием для обязательной выписки ЭСФ. Однако неплательщик НДС всё равно обязан проверить остальные основания, перечисленные в статьях 207–209 Налогового кодекса.
- Работы и услуги нерезидента: Если местом реализации признаётся Казахстан, покупатель — плательщик НДС выписывает ЭСФ после уплаты НДС за нерезидента, но не позднее 5 календарных дней после даты такой уплаты. Это правило нельзя автоматически распространять на покупателя, который не является плательщиком НДС.
Штрафы за просрочку и невыписку (Ст. 280-1 КоАП)
Для распространённых случаев общий срок выписки ЭСФ составляет 15 календарных дней после даты совершения оборота, однако Налоговый кодекс предусматривает специальные сроки для отдельных операций. Перед расчётом просрочки нужно определить вид оборота и применимое правило.
| Нарушение | Первый раз (за год) | Повторно (в течение года) |
|---|---|---|
| Просрочка выписки ЭСФ | Предупреждение | Штраф 20 МРП (малый бизнес) / 50 МРП (средний) / 100 МРП (крупный) |
| Невыписка ЭСФ вообще | Предупреждение | Штраф 40 МРП (малый бизнес) / 100 МРП (средний) / 150 МРП (крупный) |
СНТ и Виртуальный склад
Модуль «Виртуальный склад» продолжает функционировать. С 1 июля 2026 года для идентификации товаров применяется код NTIN, а при временном отсутствии карточки товара может использоваться XTIN в предусмотренном порядке. Эти идентификаторы используются, в частности, в кассовых чеках, ЭСФ и СНТ, но сами по себе не подтверждают происхождение товара и не заменяют первичные документы.
Система заблокировала выписку ЭСФ?
Сначала установите точное основание ограничения, вид уведомления и срок его исполнения. Для подтверждения операций обычно нужны договоры, первичные документы, сведения об оплате и фактическом движении товара или оказании услуги. Специалист может помочь собрать ответ и проверить документы, но результат зависит от обстоятельств конкретного дела.
Делегировать выписку ЭСФ