С 1 января 2026 года базовая ставка НДС в Казахстане выросла с 12% до 16%, а предельный порог оборота для обязательной регистрации установлен в размере 10 000 МРП. При МРП 4 325 тенге это 43 250 000 тенге. При расчёте порога важно учитывать состав оборота по статье 99 НК РК, а не только выручку по одной услуге.
Для отдельных лекарств, медицинских изделий, комплектующих, технических вспомогательных средств и облагаемых медицинских услуг предусмотрена специальная ставка 5% в 2026 году. С 1 января 2027 года для тех же операций статья 503 НК РК устанавливает 10%.
Правила различаются. Для товара проверяют перечень № 1204 и предусмотренные им условия. Для услуги решающими являются её медицинский характер, статус субъекта здравоохранения и лицензия; услуги из перечня № 1203 при установленных законом целях финансирования или лечения освобождаются от НДС.
Давайте разбираться вместе. Я расскажу, кто реально подпадает под 5%, какие документы нужны, где частные клиники чаще всего ошибаются и что делать уже сейчас, чтобы в 2027 году переход на 10% не стал для вас сюрпризом.
пониженная ставка НДС в 2026 для медицины
промежуточная ставка с 1 января 2027
базовая ставка для всех, кто не подпадает под льготу
Ключевой факт: разница ставок 5% и 16% составляет 11 процентных пунктов. При базе 8 млн тенге без НДС начисленный налог равен соответственно 400 000 и 1 280 000 тенге. Это сравнение исходящего НДС, а не готовый расчёт платежа в бюджет: итог зависит от входного НДС и условий цены.
1. Что говорит Налоговый кодекс: ставки, сроки, переход на 10%
Новый Налоговый кодекс Президент подписал 18 июля 2025 года. В силу он вступил с 1 января 2026. И вот что там про медицину.
Статья 503 НК РК устанавливает базовую и специальные ставки. Для рассматриваемой темы важны:
- 16% — базовая ставка, если Кодексом не предусмотрено иное.
- 5% — с 1 января 2026 года для операций, указанных в пункте 2 статьи 503.
- 10% — с 1 января 2027 года для тех же операций.
Переход на 10% уже предусмотрен статьёй 503, поэтому отдельная перерегистрация плательщика НДС из-за смены ставки не требуется. Но к 2027 году нужно обновить договоры, цены и учётные системы.
Подпункт 28) статьи 474 НК РК освобождает от НДС включённые в перечень № 1203 лекарства и медицинские услуги в рамках ГОБМП/ОСМС, а также для лечения орфанных и социально значимых заболеваний.
| Ставка НДС | Период | Кому применяется |
|---|---|---|
| 5% | 2026 год | Товары из перечня № 1204 и облагаемые медицинские услуги лицензированного субъекта здравоохранения |
| 10% | с 01.01.2027 | Автоматически для той же категории |
| 16% | с 01.01.2026 | Базовая ставка, если специальная ставка или освобождение не применяются |
| Без НДС | при выполнении условий | Лекарства и медуслуги из перечня № 1203 по подпункту 28) статьи 474 |
Если 8 миллионов тенге — это стоимость услуг без НДС, начисленный НДС составит 1 280 000 тенге при ставке 16% либо 400 000 тенге при ставке 5%. Разница — 880 000 тенге. Если цена уже включает НДС, расчёт выполняется иначе; сумма к уплате также уменьшается на разрешённый зачёт входного НДС.
Для товаров ставка 5% зависит от включения в перечень № 1204 и выполнения его условий. Для медицинских услуг товарный перечень № 1204 не применяется: их режим определяется пунктом 2 статьи 503 и, для освобождения, подпунктом 28) статьи 474 и перечнем № 1203.
2. Кто подпадает под 5%: три категории
Перечень товаров, подпадающих под пониженную ставку, утверждён постановлением Правительства РК № 1204 от 31 декабря 2025 года. В нём 242 товарные позиции с кодами ТН ВЭД ЕАЭС. Разложим по категориям.
Категория 1. Лекарственные средства
Ставка 5% применяется к лекарственным средствам из перечня № 1204 при выполнении установленных условий. Для зарегистрированных препаратов подтверждают регистрацию в РК; для разрешённого ввоза незарегистрированных препаратов требуется соответствующий разрешительный документ.
Важно для аптек и дистрибьюторов
Если препарат зарегистрирован как ЛС, но отсутствует в перечне — ставка 16%. Поэтому критически важно сверить ассортимент с перечнем ПП № 1204.
Категория 2. Медицинские изделия и комплектующие
Перечень № 1204 охватывает отдельные медицинские изделия, оборудование, комплектующие, реагенты, расходные и реабилитационные средства. Формулировка перечня важнее бытового назначения товара: нужно одновременно проверить код ТН ВЭД ЕАЭС, описание позиции и специальные условия, указанные в постановлении.
Категория 3. Медицинские услуги
Ставка 5% применяется к облагаемым медицинским услугам, в том числе оказываемым в комплексе, если их оказывает субъект здравоохранения, имеющий лицензию на медицинскую деятельность. Перечень товаров № 1204 здесь не используется. Исключение — медицинские услуги, освобождённые по подпункту 28) статьи 474 и включённые в перечень № 1203.
5%: Облагаемая медицинская услуга лицензированного субъекта здравоохранения, которая не подпадает под освобождение.
Без НДС: Услуга из перечня № 1203 при выполнении условий подпункта 28) статьи 474 НК РК.
16%: Немедицинские товары и услуги либо иные облагаемые операции, для которых Кодекс не установил специальную ставку.
Лицензия — обязательное условие для медицинских услуг по ставке 5%. Работа без требуемой лицензии создаёт не только налоговый риск: отдельная ответственность возможна и за саму нелицензированную деятельность. Налоговые последствия определяются по каждой фактической операции и периоду.
3. Условия для льготы: что нужно проверить прямо сейчас
Универсального набора из четырёх условий для всех операций нет. Товары и медицинские услуги проверяются по разным правилам.
Условие 1. Лицензия
Для медицинских услуг нужна действующая лицензия на медицинскую деятельность с соответствующими подвидами. Для обращения товаров проверяют применимые разрешительные требования: фармацевтическую или медицинскую лицензию либо уведомление об оптовой реализации медицинских изделий — в зависимости от операции.
Условие 2. Товар в перечне Правительства
Постановление № 1204 содержит 242 товарные позиции. Сопоставляют не только код ТН ВЭД ЕАЭС, но и описание позиции, назначение и оговорённые условия. Само по себе внешнее сходство товара с медицинским изделием права на ставку 5% не создаёт.
Не надейтесь на «похожий» код
Классификацию подтверждают по действующему коду и описанию товара. Нельзя подбирать «похожий» код ради ставки; при сомнении необходимы технические документы и корректное классификационное решение.
Условие 3. Регистрация в РК
Для лекарственных средств проверяют государственную регистрацию в РК. В предусмотренных законодательством случаях незарегистрированный препарат может ввозиться на основании разрешительного документа. Для медицинских изделий учитывают требования государственной регистрации и исключения, установленные законодательством о здравоохранении.
Условие 4. Документы о целевом назначении
Для импорта подтверждают целевое назначение товара и иные условия перечня. Состав документов зависит от вида товара и таможенной процедуры: регистрационный или разрешительный документ, товаросопроводительные и технические документы, сведения о коде и назначении. Пакет следует согласовать до ввоза, не полагаясь на универсальный список из трёх документов.
4. Что освобождено от НДС: почему это не ставка 0%
Теперь — про освобождение. Его часто путают с пониженной ставкой, а зря. Потому что:
5% — НДС начисляется, но по сниженной ставке. Входной НДС по таким операциям можно брать в зачёт.
Освобождение («Без НДС») — НДС покупателю не предъявляется. Это другой режим, чем нулевая ставка; входной НДС, относящийся к необлагаемому обороту, не разрешается к зачёту по общему правилу.
При сочетании облагаемых и необлагаемых оборотов разрешённый зачёт входного НДС определяют по статьям 487–489 НК РК: пропорциональным методом либо через раздельный учёт, с распределением общих затрат по установленной формуле.
ГОБМП
Лекарства и медицинские услуги освобождаются от НДС при реализации в рамках ГОБМП, если они включены в перечень № 1203 и выполнены условия статьи 474 НК РК. В ЭСФ указывается «Без НДС».
ОСМС
Для операций в системе ОСМС действует тот же режим освобождения при включении лекарства или медицинской услуги в перечень № 1203 и документальном подтверждении соответствующих условий.
Орфанные заболевания
Лекарства и медицинские услуги для лечения орфанных заболеваний освобождаются не автоматически, а при соответствии перечню № 1203 и назначению операции. Министерство здравоохранения сообщало примерно о 1 200 наименованиях препаратов для орфанных и социально значимых заболеваний в составе освобождённого перечня.
Социально значимые заболевания
Для лечения социально значимых заболеваний освобождение также требует соответствия перечню № 1203. Нельзя применять «Без НДС» только по названию диагноза без проверки конкретного лекарства или услуги и основания реализации.
5. Подводные камни для частных клиник
Вот здесь, коллеги, самое горячее. Потому что именно на этом этапе я вижу больше всего ошибок.
Камень № 1. «У меня лицензия — значит, все услуги под 5%»
Не все. Нужно определить, является ли конкретная операция медицинской услугой, охватывается ли она лицензией и не подпадает ли под освобождение. Нельзя заранее отнести всю косметологию или весь массаж к 16%: налоговый режим зависит от медицинского характера процедуры, лицензии и фактических документов. Продажа БАДов классифицируется отдельно от медицинских услуг.
Камень № 2. «У меня маленький оборот, я не плательщик НДС»
В 2026 году порог равен 10 000 МРП = 43 250 000 тенге. Заявление подают не позднее пяти рабочих дней после превышения, а если одна сделка сама превышает порог — до её совершения. Часть 3 статьи 269 КоАП предусматривает 50 МРП за нарушение срока заявления; часть 5 статьи 275 — 15% облагаемого оборота за период непостановки. Применение каждой нормы зависит от состава установленного нарушения.
Камень № 3. В одной клинике — облагаемые и освобождённые обороты
Клиника может одновременно оказывать освобождённые услуги по ОСМС, облагаемые медицинские услуги по ставке 5% и совершать иные операции по ставке 16%. Для входного НДС налогоплательщик применяет один из методов статьи 487: пропорциональный либо раздельный. При раздельном методе общие расходы распределяются по формуле статьи 489.
Камень № 4. «Льгота для всех лекарств»
Ставка 5% применяется только к товарам из перечня № 1204 при соблюдении условий. Ошибка в классификации может привести к корректировке НДС, начислению пени и ответственности при наличии состава правонарушения. Поэтому код, описание, регистрацию и документы проверяют до первой реализации или импорта.
6. Что изменится в 2027: рост с 5% до 10% — как подготовиться
С 1 января 2027 года ставка 5% превратится в 10%. Автоматически. Без дополнительных законов.
Если налоговая база без НДС составляет 8 млн тенге, начисленный НДС равен 400 000 тенге при ставке 5% и 800 000 тенге при ставке 10%. Фактическая сумма к уплате зависит от разрешённого зачёта входного НДС и условий договора о цене.
Что я советую делать уже сейчас:
- Сравните сроки крупных закупок. Не предполагается автоматически, что цена поставщика будет ниже: оцените ставку на конкретный товар, право на зачёт, договорную цену и денежный поток.
- Пересмотрите долгосрочные контракты. Договоры, которые переходят на 2027 год, должны учитывать повышение ставки. Если в договоре цена указана «включая НДС 5%» — в 2027 году вы будете платить разницу из своего кармана.
- Запланируйте рост налоговой нагрузки в бюджете. Сейчас, в середине 2026 года, самое время заложить в финансовую модель увеличение НДС вдвое с января 2027.
- Проверьте автоматизацию. Ваша учётная система должна уметь менять ставку НДС с 5% на 10% с 01.01.2027. Если у вас 1С или другая ERP — убедитесь, что обновление будет установлено вовремя.
7. FAQ — Часто задаваемые вопросы
1. Я частная клиника, у меня есть лицензия. Все мои платные услуги под 5%?
Не все. Ставка 5% применяется к облагаемым медицинским услугам лицензированного субъекта здравоохранения. Услуги из перечня № 1203 в рамках ГОБМП/ОСМС либо для лечения орфанных и социально значимых заболеваний освобождаются от НДС. Немедицинские услуги и товары классифицируются отдельно.
2. Я импортёр лекарств. Как мне применить 5% на таможне?
Проверьте перечень № 1204 и условия конкретной позиции. Обычно требуются документы о классификации и назначении товара, регистрации либо разрешении на ввоз незарегистрированного препарата, а также применимая лицензия или уведомление. Точный комплект зависит от товара и процедуры ввоза.
3. У меня ГОБМП и платные услуги одновременно. Как вести учёт?
Разделите облагаемые и освобождённые обороты. Для зачёта входного НДС статьи 487–489 допускают пропорциональный метод либо раздельный учёт. При раздельном учёте общие расходы распределяются по формуле, а расчёт выполняется за налоговый период — календарный квартал.
4. Что будет, если я ошибусь со ставкой в 2026 году?
Недоимку нужно доплатить и исправить отчётность. Объявленный переходный режим до конца 2026 года касается микро- и малого бизнеса и не означает автоматического прощения любой ошибки. До применения послабления нужно проверить статус налогоплательщика, вид нарушения и действующий порядок.
5. У меня оборот 30 миллионов в год. Я обязан встать на учёт по НДС?
Сам по себе оборот 30 млн тенге ниже порога 43 250 000 тенге, но нужно посчитать весь оборот, включаемый в минимум по статье 99 НК РК. При превышении заявление подают не позднее пяти рабочих дней; по одной сделке сверх порога — до её совершения. За нарушение срока статья 269 КоАП предусматривает 50 МРП, то есть 216 250 тенге в 2026 году.
6. А что с 2027 годом? Мне нужно будет перерегистрироваться?
Нет. Ставка меняется автоматически — это заложено в статье 503 НК РК. Никаких заявлений подавать не нужно. Но вам нужно обновить учётную систему и проверить, что с 01.01.2027 счета-фактуры формируются со ставкой 10%, а не 5%.
8. Практический чек-лист: как проверить, подпадает ли ваш бизнес под льготу
Я подготовила пошаговый план. Пройдите по пунктам — и вы будете точно знать, на какой ставке вы работаете.
Шаг 1. Проверьте лицензию.
Действующая ли лицензия на медицинскую/фармацевтическую деятельность? Не истекает ли срок в ближайшие полгода? Соответствуют ли фактические виды деятельности тем, что указаны в лицензии? Если на любой вопрос ответ «нет» — сначала лицензия, потом льгота.
Шаг 2. Сверьте товары и услуги с перечнем ПП № 1204.
Для товаров сверяйте код, описание и условия перечня № 1204. Для услуг отдельно определяйте медицинский характер, лицензию и наличие освобождения по перечню № 1203.
Шаг 3. Определите освобождённые операции.
Проверьте операции в рамках ГОБМП/ОСМС и для лечения орфанных или социально значимых заболеваний по перечню № 1203. При подтверждении указывается «Без НДС», а не ставка 0%.
Шаг 4. Разделите учёт.
Разделите облагаемые и освобождённые обороты. Выберите допустимый метод определения разрешённого зачёта по статьям 487–489 НК РК и закрепите его в налоговой учётной политике.
Шаг 5. Проверьте регистрацию товаров.
Все ли лекарства зарегистрированы в РК? Все ли медизделия в Государственном реестре? Для импорта: готов ли пакет документов для таможни?
Шаг 6. Настройте ЭСФ.
Проверьте корректное формирование ЭСФ со ставкой 5%, базовой ставкой 16% и отметкой «Без НДС». Ставка 10% для рассматриваемых операций понадобится с 1 января 2027 года.
Шаг 7. Запланируйте переход на 2027 год.
Заложите в бюджет переход на 10%. Проверьте долгосрочные договоры и ИТ-систему. Срок крупных закупок выбирайте после расчёта договорной цены, права на зачёт и денежного потока.
9. Итог: что всё это значит для вашего бизнеса
Специальная ставка в медицине действительно ниже базовой, но её нельзя применять по одному названию отрасли. Для товаров и услуг действуют разные основания, а освобождение нужно отличать от нулевой ставки.
Первое. Для товаров проверяйте перечень № 1204 и условия позиции; для медицинских услуг — статус субъекта здравоохранения, лицензию и возможное освобождение по перечню № 1203.
Второе. При смешанных оборотах определяйте разрешённый зачёт выбранным допустимым методом: пропорционально либо через раздельный учёт.
Третье. До перехода на 10% пересмотрите договорные цены, настройки ЭСФ и бюджет. Решение о сроке закупки принимайте с учётом права на зачёт и условий поставщика, а не только ставки.
Если вы не уверены в ставке, проверьте операцию до выставления документов. Мы поможем определить, где применяется 5%, где 16%, а где нужно указывать «Без НДС», и настроить учёт с учётом входного НДС.
Работаете в медицине? Проверьте свою ставку НДС
Аудит перечня услуг, раздельный учёт НДС, подготовка к проверке. Первая консультация — бесплатно.
Написать в WhatsAppConsaltProfi — Астана, Достык 3, офис 6. WhatsApp: +7 701 331 44 20. Сайт: consaltprofi.kz
Нормативная база
Налоговый кодекс РК: статьи 99, 101, 474, 479, 487–489, 503 и 504; постановления Правительства РК от 31 декабря 2025 года № 1203 и № 1204; статьи 269 и 275 КоАП РК. МРП на 2026 год — 4 325 тенге.
ConsaltProfi помогает медицинским организациям, частным клиникам, аптекам и дистрибьюторам проверять налоговую квалификацию операций, настраивать учёт НДС и готовиться к налоговому контролю.
Автор: Роза Аралбековна | ConsaltProfi | г. Астана, ул. Достык 3, офис 6 | WhatsApp: +7 701 331 44 20 | consaltprofi.kz